არგინინი გამოიყენება, როგორც აზოტის შემნახველი და სატრანსპორტო მოლეკულა ბევრ მცენარეში. არგინინი ხელს უწყობს ნაყოფისა და ყვავილის ჰორმონების სინთეზს. ეს არის პოლიამინების (პუტრეცინი, სპერმიდინი და სპერმინი), პროლინის, ალკალოიდების, ორნიტინის, ციტრულინისა და აზოტის ოქსიდის სინთეზის წინამორბედი. ასევე, მნიშვნელოვანია სტრესული პირობების დასაძლევად. რიზოსფეროში არგინინის შეტანის შესახებ ჩატარებულმა კვლევებმა აჩვენა ფესვების რაოდენობის ზრდა. არგინინი ხელს უწყობს აუქსინის IBA-ს დადებით გავლენას ფესვებზე, ზრდის როგორც ფესვების რაოდენობას, ასევე მათ სიგრძეს.